倉址由城外遷到城內

德州漕倉遺址有兩處，即北廠漕倉遺址和南門內漕倉遺址。
北廠遺址位于德城區天衢工業園的北廠村一帶。該遺址占地約15000平方米，現為北廠村村舍和農田，僅保留原北廠街格局，主要功能已轉換為農村居住區。村內曾發現大量明清時期的建筑殘存如石柱、石構件等。現在的北廠村西立有“全國重點文物保護單位京杭大運河南運河德州段”和“北廠漕倉遺址”兩塊石碑。德州倉從初設開始，一直到遷入城內為止，在北廠村一共呆了320年。
明正統十四年（1449），基于倉廒的安全考慮，朝廷將德州水次倉連同預備倉一并移入德州城內。德州倉因庫容大且附帶有級別較高的管倉衙門戶部分司，設在南門內東側的顯要位置。預備倉移于城內后分為兩倉，移西門者，曰常豐倉；移城隍廟者，曰預備倉。崇禎元年（1628）常豐倉遭遇火災，倉項歸并德州水次倉。原水次倉改名“常德倉”，并開始擔負支發駐防兵及運軍月糧的任務。
清代德州倉位置未變，只是倉儲規模和面積有所增大。清朝的滿洲兵米因由此處發放，故名曰“常德兵米”。城內德州倉的范圍大致包括今市檢察院和德城區委兩個大院連起來，南起東方紅路，北至三八路的這一區域。其中德城區委處原有一個大海子，海子北涯即是倉廒所在地。